La instancia también abrió la investigación contra toda la cúpula militar de ese país, por el caso de la visita de las FARC-EP a la localidad de Conejo en La Guajira.
La Procuraduría General de la República de Colombia abrió una investigación contra el Ministro de Defensa de ese país, Luis Carlos Villegas, y toda la cúpula militar, por la ausencia de la Fuerza Pública en el corregimiento de Conejo (La Guajira), lo que permitió el ingreso del Secretariado de las Fuerzas Armadas Revolucionarias de Colombia- Ejército del Pueblo (FARC-EP).
El Ministerio Público busca establecer si se impartió una orden para que las Fuerzas Militares abandonaran el territorio, en el que hicieron presencia los negociadores de la guerrilla el pasado 18 de febrero, cuando impartieron un evento público para la socialización de los acuerdos de paz alcanzados en La Habana, Cuba.